Chakra jest to połączona siła fizyczna z mentalną ninja. bez chakry nie możemy używać żadnych technik ninjutsu ani genjutsu tylko taijutsu chakra jest prowadzona przez małe żyłki podobne do tych które przenoszą krew chakra może zabić człowieka bo odbiera mu naturalną energie  ninja dy się zbyt nadwyręży się ikumuluje jej zbyt wiele można się zabić istnieje kilka technik które używają ogromne zasoby chakry np. Chidori, Sharingan, Kage Bunshin no Jutsu Kuchiyose no Jutsu. żyłki z chakrą to układ, którego zadaniem jest równomierne rozprzestrzenianie chakry po całym ciele. To właśnie w nim krążą pozostałości po wykonywanych technikach.Ten układ jest piętą ahilesową każdgo ninja. Ale natura wymyśliła jeszcze jeden na skórze są 64 które są niewidoczne gołym okiem nazywają sie tenketsu rozmieszczone po całym ciele jednak niektórzy ninja potrafią zablokować dopływ chakry gdy to się uda osoba która ma pozatykane nie może wykonywać technik ninjutsu ani genjutsu tylko taijutsu. Nie każdy shinobi potrafi wykorzystać 100% energii ciała i ducha niektórzy poprstu używają ogromne ilości chakry i jutsu i tak niewyjdzie zużyją tylko niepotrzebnie chakre a inni użyją mniej a będą lepsze wyniki wykonywanego jutsu